Jim Yong Kim sinh năm 1959 tại Seoul, Hàn Quốc. Gia đình ông đã chuyển sang Hoa Kỳ lúc ông mới lên 5 tuổi. Cha ông giảng dạy nha khoa tại Đại học Iowa còn mẹ ông nhận học vị tiến sĩ ngành tâm lý học[4]. Jim Yong Kim học tại Trường trung học Muscatine, nơi ông là thủ khoa, là lớp trưởng và có năng khiếu trong các môn thể thao như bóng bầu dục, bóng rổ.Sau một năm rưỡi tại Đại học Iowa, ông chuyển sang học tại Đại học Brown, nơi ông tốt nghiệp với tấm bằng danh dự xuất sắc (magna cum laude) vào năm 1982. Ông tiếp tục nhận bằng Thạc sĩ từ Trường Y khoa Harvard vào năm 1991, và bằng Tiến sĩ từ Đại học Harvard, khoa Nhân học, vào năm 1993. Ông là một trong những Thạc sĩ được ghi danh đầu tiên trong chương trình thử nghiệm Tiến sĩ của trường Harvard trong các ngành khoa học xã hội.[5]